A CONGEP tem por finalidade representar através do seu presidente, as igrejas ligadas a esta convenção junto aos orgãos munícipais, estaduais e federal, dando a estas igrejas suporte administrativo, jurídico e contábil, visando a unidade por meio de um vínculo extritamente espiritual. No aspecto jurídico a CONGEP tem um departamento apto a dar esclarecimento referente a adaptação dos estatutos das igrejas convencionadas ao novo código civil brasileiro, a mesma também tem por finalidade estar prestando esclarecimento aos presidentes de igrejas quanto a política atual, e estabelecendo regras junto a mesa diretória para serem aplicadas nas igrejas locais e congregações, sempre em harmonia e respeitando a diretriz dos associados e do presidente local.